隨著醫藥工業的發展，制藥污水已成為嚴重的污染源之一。制藥工業污水主要包括四種:抗菌素工業污水;合成藥物生產污水;中成藥生產污水;各類制劑生產過程的洗滌水和沖洗污水。由于藥物品種繁多，在藥物生產過程中，需使用多種原料，生產工藝又較復雜，因而污水組成也十分復雜。

制藥污水處理設備常用工藝流程 

①抗生素污水處理流程：

污水→調節池→厭氧池→接觸氧化池→氣浮裝置→UASB反應器→接觸氧化池→輻流沉淀池→達標排放 

②合成藥物生產污水處理流程

污水→格柵→調節池→酸化池→CASS反應池→達標排放

③中藥污水處理工藝流程

污水→格柵→調節池→SBR反應池→達標排放